Deutschland ist ohne Zweifel das führende europäische Brennstoffzellen-Land. Mehrere Tausend Mitarbeiter in Universitäten, Forschungsinstituten und Firmen sind in der Brennstoffzellen-Branche angestellt. Viele dieser Organisationen sind bereits seit den ersten Tagen der Brennstoffzellen-Entwicklung aktiv, weshalb es eine Menge Wissen und Erfahrung auf diesem Gebiet gibt. So beschäftigt sich beispielsweise Siemens seit den 1950er Jahren mit vielen verschiedenen Brennstoffzellen-Technologien.

Ein großer Teil der Finanzierung dieser Arbeit kommt aus der Europäischen Union (EU) und von der deutschen Regierung, aber auch die Industrie selbst finanziert einen wesentlichen Teil ihrer eigenen Aktivitäten. Siemens, Opel, DaimlerChrysler und Vaillant sind nur einige der großen Firmen, die Arbeitsgruppen haben, welche ausschließlich zukünftige Brennstoffzellen-Produkte entwickeln.

Der Deutsche Wasserstoff- und Brennstoffzellenverband (DWV) ist die nationale Organisation für die Einführung der Wasserstoff- und Brennstoffzellen-Technologie in der Wirtschaft.

"Der DWV trägt dazu bei, indem er:

    -die verschiedenen daran interessierten Personen und Institutionen aus Forschung und
     Wirtschaft integriert,
    -ihre Bemühungen und Kapazitäten koordiniert,
    -die Öffentlichkeit und Personen des öffentlichen Lebens informiert,
    -im Sinne seiner Ziele an der einschlägigen Regelsetzung mitwirkt und
    -für den Energieträger Wasserstoff "Lobbyarbeit" leistet. "

Neben dieser nationalen Organisation gibt es noch verschiedene Initiativen, die sich auf die Brennstoffzellen- und Wasserstoff-Technologie in bestimmten Regionen Deutschlands konzentrieren. Hier seien nur einige genannt:

Kompetenz-Netzwerk Brennstoffzelle NRW (www.brennstoffzelle-nrw.de)
Brennstoffzellen Initiative Baden-Württemberg (www.brennstoffzelle-bw.de)
Brennstoffzellen-Technologie in Hessen (www.brennstoffzelle-hessen.de)
Brennstoffzellenverband Sachsen-Anhalt (www.brennstoffzelle-sa.de)
H2-Initiative Meckleburg-Vorpommern (www.wti-mv.de)
Wasserstoff Initiative Bayern (www.wiba.de) 
Initiative Brennstoffzelle - Quelle für Wärme und Strom (www.initiative-brennstoffzelle.de)
Clean Energy Partnership (www.cep-berlin.de) 

Der Brennstoffzellen- und Wasserstoffbereich in Deutschland umfasst einen weiten Zweig an Organisationen und Aktivitäten. Dies beinhaltet alle Stadien an Systementwicklung und nahezu alle Arten von Brennstoffzellen und deren Einsatzmöglichkeiten. Die Grundlagenforschung wird von vielen der großen Universitäten, wie der Universität Duisburg-Essen (H₂ Erzeugung, PEMFC), der TU Munchen (SOFC), der Universität Karlsruhe (SOFC) und der Universität Stuttgart (Membran) durchgeführt.

Große Forschungsinstitute wie das Fraunhofer ISE (tragbare BZ, H₂ Erzeugung), das Forschungszentrum Jülich (SOFC, DMFC +), das Zentrum für Sonnenenergie und Wasserstoffforschung - ZSW (PEMFC ++), das Deutsches Zentrum für Luft- und Raumfahrt – DLR (DMFC, PEMFC, SOFC), das Hydrogen Institute of Applied Technologies - HIAT (DMFC, MEA +) und das Zentrum für Brennstoffzellentechnik - ZBT (PEMFC, H₂ Erzeugung) - HIAT (DMFC, MEA +) und das Zentrum für Brennstoffzellentechnik - ZBT (PEMFC, H₂ Erzeugung) - HIAT (DMFC, MEA +) und das Zentrum für Brennstoffzellentechnik - ZBT (PEMFC, H₂ Erzeugung) sind häufig in Projekten mit beiden Seiten, Universitäten und Industrie, als Bindeglied zwischen Grundlagenforschung und Produktentwicklung, beteiligt.

Das Brennstoffzellen-Modul im U-Boot
U-212A von Siemens und HDW. 

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